Nature:全新致癌机制,与此相反驱动异常染色质成环,促进癌症发展

2021-10-20 04:22 来源:攀枝花妇科医院

乳癌的拓展与载体RNA内在无序区反之亦然(IDR)的遗传物质精神状态密切常与关。各种RNA(包括磷酸化遗传物质、肝细胞调节剂和RNA常与结合受体)中会的IDR通过尿液-尿液常与转化(LLPS)成型无所不在物,影响从细胞器成型和诱导耐受到遗传物质磷酸化的无数生物处理过程。

便是的尿液-尿液常与转化(LLPS)是仅指糅合两个不常与关遗传物质等位基因的处理过程。该处理过程时有发生在细胞核内,并能够成型具有各种物理特功能性的反之亦然,这些反之亦然可以倡导乳癌,例如急功能性帕金森氏症的时有发生拓展。在急功能性帕金森氏症中会,核孔受体(NUP98或NUP214)的长时间染色锥体易位显现出了一种精神状态糅合锥体,它总是原有核孔受体 IDR——苯丙氨酸和甘氨酸残基(FG)的串接集中于重复使用碱基。然而,IDR如何造成遗传物质有误调控和时有发生尚不正确。

2021年6月23日,西弗吉尼亚大学特拉华分校 Gang Greg Wang 团队等 Nature 发表了题为:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的分析论文。

该分析证明常与转化是乳癌成型的转子诱因,乳癌通过常与转化赢得等位基因以建立致癌磷酸化遗传物质无所不在物,这同时强化了它们的遗传物质组载体功能性并在产物处理过程中会可**神状态可视化肝细胞构造的成型。该分析是最早将常与转化与乳癌成型联系起来的分析之一。因为在其他恶功能性中会检视到了类似的遗传物质糅合,评论中会洞察的必要也可以说明其他类别的乳癌。

NUP98–HOXA9系统性联两个RNA基序和一个常与结合碱基。为了分析NUP98-IDR在帕金森氏症时有发生中会的起到,分析团队主要使用掰除了常与结合碱基的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。

他们发掘出,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种用作破坏常与-常与转化无所不在锥体的有机物)处理敏感。纯化的NUP98-IDR(N-IDR)受体在锥体外成型尿液锥体无所不在物。

为了促使风险评估FG重复使用碱基对无所不在物成型的分子量仰赖功能性和多价功能性的重要功能性,分析团队化学合成了成分并不相同数量FG重复使用碱基的合并N-IDRRNA。他们发掘出N-IDR系统性联38个或36个FG以分子量仰赖功能性的方式重复使用成型的尿液滴,那些系统性联27个或11个FG的却不能完成常与转化。断定NUP98–HOXA9中会的IDR以价仰赖和分子量仰赖的方式建立LLPS。

NUP98–HOXA9通过同源RNA与DNA常与结合,造成帕金森氏症时有发生处理过程中会的遗传物质疾患。接下来,分析团队通过肝细胞免疫沉淀和高通量基因组来风险评估IDR酪氨酸的常与转化对NUP98–HOXA9肝细胞载体功能性的影响。

结果实示, N-IDRWT/A9具有实着强化的遗传物质组占有率,而与无指派聚类定义的山峰值亚类就其。此外,宽而密集的;也强化子样山峰是N-IDRWT/A9所独特的,并且在发育期和帕金森氏症常与关遗传物质石英砂。

为了促使风险评估IDR可借的LLPS在无法说明肝细胞载体中会的起到,他们利用了遗传学和药理学的方法,证明IDR酪氨酸的LLPS在强化嵌合磷酸化遗传物质载体功能性方面的本质起到,特别是在;也强化子样山峰处看得见的那些。断定IDR强化糅合锥体的遗传物质组常与结合并且强化靶遗传物质激活。

为了的测试NUP98–HOXA9通过LLPS成型肝细胞可逆的能力也,分析团队生成了解读N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9细胞的Hi-C研究成果,探究了DNA可逆和复制彼此间的离地常与关功能性。

为了确定N-IDRWT/A9对Hi-C沾染kHz的影响,他们挤满了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9解读细胞中会500个最强力的N-IDRWT/A9夺取碱基彼此间的常与互起到计数。结果实示,N-IDRWT/A9可逆以基本上与CTCF就其的方式成型,与常与转化转子必要明确。另外,N-IDRWT/A9特异功能性可逆重新联接强化子和靶遗传物质彼此间的联接,支持了糅合磷酸化遗传物质的IDR通过常与转化在;也强化子样靶点和癌遗传物质彼此间可借DNA可逆的观点。

综上所述,该分析发掘出NUP98–HOXA9中会成分的LLPS活功能性IDR对帕金森氏症的时有发生和致癌遗传物质解读程序在的激活至关重要。这些畸变由IDR的能力也酪氨酸:1)强化磷酸化遗传物质与遗传物质组靶点的常与结合;2)倡导强化子和癌遗传物质操纵子彼此间的长程可逆。

该分析提供了一个致癌等位基因的原理功能性证据,该等位基因在产物处理过程中会倡导LLPS转子的磷酸化遗传物质常与结合和3D肝细胞合并。由于计有IDR的LLPS活功能性原子与广泛的乳癌有关,该分析洞察的必要也可以说明其他类别的乳癌。

原始出处:

Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.

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